24 сентября 2002 года в 13:59 UTC (17:59 мск) осуществлена расстыковка грузового транспортного корабля "Прогресс М-46" и Международной космической станции (МКС). "Грузовик" мягко отчалил от корпуса МКС и отправился в недолгий автономный полет. Уже через несколько часов корабль будет сведен с орбиты и сгорит в плотных слоях земнойатмосферы. Несгоревшие обломки затонут в пустынных районах южной части Тихого океана.
 В "Прогресс М-46" загружены отработанное оборудование и отходы жизнедеятельности экипажа станции. Отстыковавшись, он освободил место для причаливания очередного грузового корабля "Прогресс М1-9", старт которого намечен на 25 сентября.