23 мая 2001 года в 00:23:57 UTC (04:23:57 мск) осуществлена стыковка грузового транспортного корабля "Прогресс М1-6" и Международной космической станции (МКС). Сближение и стыковка корабля и станции произведены в автоматическом режиме под контролем экипажа МКС.
Корабль доставил на орбиту воздух, воду, продукты питания и посылки для членов второй долговременной экспедиции на МКС, а также фото- и видеоаппаратуру, рабочие инструменты для монтажа станции и систем ее обслуживания. Всего, с учетом топлива, "Прогресс М1-6" доставил на станцию 2 478 кг грузов.